Výhrady k novému zákoníku práce:

•  ve zdravotnictví budou chybět lékaři. Hlavně střední a malé nemocnice varují – tím, že bude nutné lékařům ubrat přesčasy a započítat je do pracovní doby, se může stát, že někteří by už napřesrok v červnu nemohli vůbec pracovat. Jen záchranná služba by tak potřebovala zvýšit počet lékařů na dvojnásobek. Podobně jsou na tom dopravci – silniční linková doprava bude potřebovat navíc přes 1500 řidičů, MHD 370 řidičů, České dráhy 600 nových pracovníků. Ochromeny mohou být i hasičské záchranné služby v podnicích;
• uplatnění zákoníku vyžaduje obsáhlou znalost občanského zákoníku, na nějž se nová pracovní norma v mnoha směrech odkazuje. Zejména střední a malé firmy proto budou muset vyhledávat odborné služby;
• zákoník neřeší, jak mají zaměstnavatelé postupovat v případě zrušení vedlejšího pracovního poměru. V podstatě to znamená, že lidé zaměstnaní na vedlejší pracovní poměr se od prvního ledna 2007 stanou „normálními“ pracovníky. Aby jim zaměstnavatel mohl dát výpověď, bude muset dodržet minimálně dvouměsíční výpovědní lhůtu, někdy odstupné;
• zákaz ukončení takového pracovního poměru v době prvých čtrnácti dní pracovní neschopnosti znamená, že zaměstnanci budou moci účelově utíkat do pracovní neschopnosti;
• odstupné ve výši 12násobku průměrné mzdy. Na takové odstupné budou mít nárok lidé při výpovědi ze zdravotních důvodů – při pracovním úrazu, nemoci z povolání či ohrožení nemocí z povolání. Tito lidé přitom budou moci pracovat pro jinou firmu;
• od 1.1. 2007 budou muset firmy rozdělit zaměstnance podle odpovědnosti a namáhavosti práce do osmi skupin a také nově kalkulovat mzdy. Zvýšené mzdové náklady přitom bude znamenat například fakt, že 150 hodin přesčasové práce bude nutné započítávat do platů. Mzdové náklady dále zvýší nové příplatky za práci v sobotu a v neděli nebo za práci v noci.